Derechos Humanos Sin Fronteras desde su fundación busca transversalizar el enfoque de género; principalmente busca espacios específicos para empoderar la participación de las mujeres y sus organizaciones a través de acciones que prioricen sus problemáticas más importantes y su vinculación para la protección de sus bienes comunes en las provincias altas del Cusco. Por ello institucionalmente prioriza su intervención en el fortalecimiento organizacional y empoderamiento de sus lideresas; y desde el punto de vista operativo está orientado a generar acciones de incidencia17 y participación en espacios públicos.
Con el enfoque de género, Derechos Humanos Sin Fronteras busca generar niveles equitativos de protagonismo en la toma de decisiones sobre sus derechos y bienes comunes, prioritariamente de las mujeres.